國家安全會議於89年5月奉　總統指示研提「建立我國通資訊基礎建設安全機制」建議書，經　總統於89年8月核定並轉送行政院規劃辦理，行政院於90年1月第2718次院會核定通過第一期資通安全機制計畫，成立行政院「國家資通安全會報」，並訂定「行政院國家資通安全會報設置要點」，積極推動我國資通安全基礎建設工作。

為建構我國資通安全整體環境，協調各級政府機關資通安全相關事務，健全我國整體資通安全管理，強化橫向溝通聯繫機制，將原「行政院國家資通安全會報設置要點」自行政規則提升至法規命令位階，爰訂定「國家資通安全會報設置辦法」，並自115年3月2日由行政院發布施行。